Sudán del Sur está localizado en África Oriental. Es un país sin salida al mar con frontera con seis países. En el sentido de las agujas del reloj: Sudán, al norte; Etiopía, al este; Kenia, Uganda y República Democrática del Congo al sur, y la República Centroafricana al oeste. Su punto más alto es el monte Kinyeti con 3187 m s. n. m. Hasta el 9 de julio de 2011 era parte de Sudán, entonces el mayor país en extensión de África, hasta la celebración del referéndum de independencia que tuvo lugar en enero de 2011.