La temporada 2012-2013 de la Heineken Cup fue la 18.ª edición de la máxima competición continental del rugby europeo. El número de equipos participantes fue de 24, igual que en las temporadas anteriores, divididos en 6 grupos de 4, para afrontar la primera fase de la competición. Tras las 6 jornadas correspondientes a esta primera fase, se desarrollaron los cuartos de final y semifinales, a un solo partido, y la final. La primera jornada se disputó entre los días 12, 13 y 14 de octubre de 2012, y la gran final tuvo lugar el 18 de mayo de 2013, en el Aviva Stadium de Dublín.
Este año Francia proporcionó 7 equipos al torneo, Inglaterra 6, Gales 3, Irlanda 4, Escocia 2 e Italia 2.
Jornadas
Fechas
1ª
12-13-14 de octubre de 2012
2ª
19-20-21 de octubre de 2012
3ª
7-8-9 de diciembre de 2012
4ª
14-15-16 de diciembre de 2012
5ª
11-12-13 de enero de 2013
6ª
18-19-20 de enero de 2013
Cuartos
6-7 de abril de 2013
Semifinales
27-28 de abril de 2013
Final
18 de mayo de 2013
Esta temporada Francia tuvo 7 representantes en el torneo ya que el año anterior había sido campeón de la European Challenge Cup un equipo de este país, el Biarritz Olympique. Por otro lado, Irlanda tuvo 4 representantes, ya que el año anterior el campeón de este torneo había sido Leinster Rugby. El resto de los países tuvieron el número de representantes previsto en la organización de la European Rugby Cup.
La fase de grupos comenzó el 12 de octubre de 2012 y terminó el 20 de enero de 2013. Los 24 equipos quedaron divididos de 4 en 4 en 6 grupos. Cada equipo tuvo que disputar 6 partidos, 3 como local y otros 3 como visitante. De los 24 equipos solo 8 pasaron a la fase de cuartos de final. Estos 8 equipos fueron los 6 campeones de grupo y los restantes 2 equipos con mayor puntuación.
El desarrollo de la fase de grupos transcurrió de la siguiente manera: