Ο Άγιος Παντελεήμονας είναι οικισμός της Κοινότητας Ορεινού, της δημοτικής ενότητας Μακρύ Γιαλού, του δήμου Ιεράπετρας, της περιφερειακής ενότητας Λασιθίου, στην περιφέρεια Κρήτης, σύμφωνα με το πρόγραμμα Καλλικράτης. Πριν το σχέδιο Καποδίστριας και το πρόγραμμα Καλλικράτης, ανήκε στην επαρχία Σητείας του νομού Λασιθίου, στο γεωγραφικό διαμέρισμα Κρήτης.