Windhausen ist ein Gemeindeteil von Aislingen im schwäbischen Landkreis Dillingen an der Donau in Bayern. Windhausen, das als Ortsteil von Baumgarten am 1. Mai 1978 zur Gemeinde Aislingen kam, liegt 500 Meter nordöstlich von Baumgarten beiderseits des Lohgrabens.