Die Gemeinde Vilabertran liegt in der autonomen Region Katalonien. Sie gehört zur Provinz Girona im Nordosten Spanien und ist Teil des Comarca Alt Empordà. Sie grenzt unmittelbar an Figueres und wird ihrerseits begrenzt durch den Verlauf der Flüsse La Muga im Norden und dem Manol im Süden.