Der Kanton San Cristóbal befindet sich in der Provinz Galápagos im Westen von Ecuador. Er besitzt eine Fläche von 843,5 km². Im Jahr 2020 lag die Einwohnerzahl schätzungsweise bei 9670. Verwaltungssitz des Kantons ist die Kleinstadt Puerto Baquerizo Moreno mit 6672 Einwohnern. Der Kanton San Cristóbal wurde am 18. Februar 1973 zeitgleich mit der Provinz Galápagos gegründet.