Brookhaven ist eine Stadt (town) im Suffolk County des US-Bundesstaates New York. Sie erstreckt sich von der Nord- bis zur Südküste von Long Island und hatte bei der Volkszählung von 2010 486.040 Einwohner. Es handelt sich dabei nicht um eine Stadt im eigentlichen Sinne, sondern einen Verwaltungszusammenschluss eines größeren, sehr unterschiedlich besiedelten Gebietes ohne klares Zentrum.