Bekannt wurde Michael Müller mit seinem Magazin KOMMA – Das Magazin für Freiheit & christliche Kultur, dessen Chefredakteur er seit 2000 war.[4] Kernthemen in den über hundert Ausgaben waren Werte und Haltungen, religiös-soziale Phänomene wie „Islamisierung“ sowie gesellschaftliche Kontroversen, z. B. um Ehe und Homosexualität.[1]
Sein soziales Engagement zeigte sich u. a. in der Gründung des Vereins Hilfe vor Ort, der Bedürftigen in Aachen unbürokratische Hilfe bot.[3]
An seiner Publikation Die leise Diktatur – Das Schwinden der Freiheit beteiligten sich als Autoren:
Joachim Kardinal Meisner. Mit dem Herzen sehen. 2000, ISBN 3-928272-12-8.
Der deutsche Esel auf dem Eis. Herausforderungen für Politik, Kirche und Gesellschaft. 2004, ISBN 978-3-928272-65-0.
Muckefuck und Mauerfall. eine Zeitreise durch Deutschland. 2005, ISBN 3-928272-68-3.
Cerkev in spolnost (Originaltitel: Kirche und Sex. übersetzt von Urška Križman und Marija Ramšak). Slomškova Založba, Maribor 2006, ISBN 961-6522-26-4 (slowenisch).
mit Achim Kaiser: Unser Aachen. Liebeserklärungen an eine Stadt. 2006, ISBN 978-3-928272-79-7.
Armes Deutschland. Glossen zu Wendezeit und Zeitenwende. 1999, ISBN 3-928272-05-5.
Stürmische Zeiten. Die katholische Kirche in der 2.Hälfte des 20. Jahrhunderts. 1999, ISBN 3-928272-07-1.
Der verborgene Schatz. Erzählungen, Märchen, Fabeln. 1999, ISBN 3-928272-08-X.
Abschied vom Himmel. Im Spannungsfeld von Kirche und Welt. 1999, ISBN 3-928272-10-1.
Mit dem Herzen sehen. Chance und Auftrag der Kirche zu Beginn des dritten Jahrtausends. Stefan Rehder im Gespräch mit Joachim Meisner. 2000, ISBN 3-928272-12-8.