Finnlakeviridae

Finnlakeviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren, die im April 2023 ihre genaue taxonomisch Zuordnung unter den Preplasmiviricota der Bamfordvirae erfahren hat.^[2] Die Familie enthält eine einzige Gattung, Finnlakevirus, und die eine einzige Spezies (Art), Finnlakevirus FLiP (veraltet Flavobacterium virus FLiP). Die natürlichen Wirte sind gramnegative Bakterien, daher werden die Finnlakeviridae nicht-taxonomisch als Bakteriophage klassifiziert.^[1][4]

Finnlakeviridae
TEM-Aufnahme von Virionen des Flavobacterium- Phagen FLiP. Balken 100 nm.[1]
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Varidnaviria[2] Reich: Bamfordvirae[2] Phylum: Preplasmiviricota[2] Klasse: Ainoaviricetes[2] Ordnung: Lautamovirales[2] Familie: Finnlakeviridae[3] Gattung: Finnlakevirus
Taxonomische Merkmale
Genom: ssDNA zirkulär Baltimore: Gruppe 2 Symmetrie: ikosaedrisch Hülle: behüllt?
Wissenschaftlicher Name
Finnlakeviridae
Links
ICTV Taxon History: 201907846 (Familie), 201907847 (Gattung) NCBI Taxonomy: 2732901 (Familie), 2733303 (Gattung) PhagesDB: FLiP

Kryo-EM-Rekonstruktion eines Virions des Flavo­bac­terium-Phagen FLiP (Finnlkeviridae).^[1]

Der Phage FLiP wurde 2010 mit seinem Wirtsbakterium aus einem borealen Süßwasserhabitat in Mittelfinnland isoliert. Phage FLiP ist das erste beschriebene einzelsträngige DNA-Virus mit einer internen Membran. Das Kapsid ist ikosaedrisch mit der Triangulationszahl pseudo T = 21 dextro. Das Hauptkapsidprotein (englisch major capsid protein, MCP) ähnelt dabei dem von Pseudoalteromonas phage PM2 (Spezies Pseudoalteromonas virus PM2, Gattung Corticovirus).^[5][4]

Genom

Genomekarte von Flavobacterium phage FLiP.^[1]

Schemazeichnung eines Virions der Gattung Finnlakevirus, Querschnitt und Außenansicht

Das Genom von Phage FLiP ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem zirkulären Einzelstrang-DNA-Molekül (ssDNA) mit einer Länge von etwa 9,2 kb (Kilobasen).^[4]

Systematik

Die Systematik der Familie Finnlakeviridae ist nach ICTV mit Stand Mai 2024 wie folgt:^[6][7]

Familie Finnlakeviridae

• Gattung Finnlakevirus (monotypisch)
  • Spezies Finnlakevirus FLiP (monotypisch)
    • Flavobacterium-Phage FLiP (englisch Flavobacterium phage FLiP)