Finnlakeviridae

Finnlakeviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren, die im April 2023 ihre genaue taxonomisch Zuordnung unter den Preplasmiviricota der Bamfordvirae erfahren hat.^[2] Die Familie enthält eine einzige Gattung, Finnlakevirus, und die eine einzige Spezies (Art), Finnlakevirus FLiP (veraltet Flavobacterium virus FLiP). Die natürlichen Wirte sind gramnegative Bakterien, daher werden die Finnlakeviridae nicht-taxonomisch als Bakteriophage klassifiziert.^[1][4]

Finnlakeviridae
TEM-Aufnahme von Virionen des Flavobacterium- Phagen FLiP. Balken 100 nm.[1]
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Varidnaviria[2] Reich: Bamfordvirae[2] Phylum: Preplasmiviricota[2] Klasse: Ainoaviricetes[2] Ordnung: Lautamovirales[2] Familie: Finnlakeviridae[3] Gattung: Finnlakevirus
Taxonomische Merkmale
Genom: ssDNA zirkulär Baltimore: Gruppe 2 Symmetrie: ikosaedrisch Hülle: behüllt?
Wissenschaftlicher Name
Finnlakeviridae
Links
ICTV Taxon History: 201907846 (Familie), 201907847 (Gattung) NCBI Taxonomy: 2732901 (Familie), 2733303 (Gattung) PhagesDB: FLiP

Kryo-EM-Rekonstruktion eines Virions des Flavo­bac­terium-Phagen FLiP (Finnlkeviridae).^[1]

Der Phage FLiP wurde 2010 mit seinem Wirtsbakterium aus einem borealen Süßwasserhabitat in Mittelfinnland isoliert. Phage FLiP ist das erste beschriebene einzelsträngige DNA-Virus mit einer internen Membran. Das Kapsid ist ikosaedrisch mit der Triangulationszahl pseudo T = 21 dextro. Das Hauptkapsidprotein (englisch major capsid protein, MCP) ähnelt dabei dem von Pseudoalteromonas phage PM2 (Spezies Pseudoalteromonas virus PM2, Gattung Corticovirus).^[5][4]

Genom

Genomekarte von Flavobacterium phage FLiP.^[1]

Schemazeichnung eines Virions der Gattung Finnlakevirus, Querschnitt und Außenansicht

Das Genom von Phage FLiP ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem zirkulären Einzelstrang-DNA-Molekül (ssDNA) mit einer Länge von etwa 9,2 kb (Kilobasen).^[4]

Systematik

Die Systematik der Familie Finnlakeviridae ist nach ICTV mit Stand Mai 2024 wie folgt:^[6][7]

Familie Finnlakeviridae

• Gattung Finnlakevirus (monotypisch)
  • Spezies Finnlakevirus FLiP (monotypisch)
    • Flavobacterium-Phage FLiP (englisch Flavobacterium phage FLiP)

Einzelnachweise

1. S. Mäntynen, E. Laanto, L. R. Sundberg, M. M. Poranen, H. M. Oksanen: ICTV Report Consortium: ICTV Virus Taxonomy Profile: Finnlakeviridae, in: The Journal of General Virology, Band 101, Nr. 9, September 2020, S. 894–895, doi:10.1099/jgv.0.001488, PMID 32840474, ICTV (Memento des Originals vom 23. April 2021 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org.
2. ICTV: Master Species Lists, § ICTV_Master Species List 2022 MSL38.v1.xlsx vom 8. April 2023.
3. ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
4. ICTV Report Finnlakeviridae. Abgerufen am 23. März 2021 (englisch).
5. NCBI: Pseudoalteromonas virus PM2 (species)
6. ICTV: Taxonomy Browser.
7. ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).

Weblinks

• ICTV Report: Finnlakeviridae