EHF-Pokal der Frauen 1999/2000
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Am EHF-Pokal 1999/2000 nahmen Handball-Vereinsmannschaften teil, die sich in der vorangegangenen Saison in ihren Heimatländern über die Platzierung in der heimischen Liga für den Wettbewerb qualifiziert haben. Der EHF-Pokal wurde diese Saison das siebte Mal ausgespielt. Titelverteidiger aus der Vorsaison war die dänische Mannschaft Viborg HK.