Er unterschrieb im Dezember 2004 einen Sechsjahresvertrag bei den Fighting Irish, der ihm zwei Millionen US-Dollar pro Jahr einbrachte. Nur ein Jahr später, im Oktober 2005, erhielt er einen neuen Zehnjahresvertrag, der ihm zwischen 30 und 40 Millionen Dollar einbringen sollte und ihn damit zu einem der bestverdienenden Collegetrainer machte. Von 2000 bis 2004 war er als Offensive Coordinator bei den New England Patriots beschäftigt, die in der Zeit zweimal den Super Bowl gewannen. Von 2005 bis 2009 war er Head Coach der University of Notre Dame. Seine Bilanz in den Jahren, die er für die Fighting Irish tätig war, liegt bei 35 Siegen und 27 Niederlagen. Weis wurde aufgrund seiner Erfolglosigkeit am 30. November 2009 entlassen.
2 Raul Allegre|
3 Matt Stover|
5 Sean Landeta|
6 Matt Cavanaugh|
9 Matt Bahr|
11 Phil Simms|
15 Jeff Hostetler|
21 Reyna Thompson|
22 Lee Rouson|
23 Perry Williams|
24 Ottis Anderson(MVP)|
25 Mark Collins|
26 Dave Duerson|
27 Rodney Hampton|
28 Everson Walls|
29 Myron Guyton|
30 Dave Meggett|
34 Lewis Tillman|
43 David Whitmore|
44 Maurice Carthon|
46 Roger Brown|
47 Greg Jackson|
51 Bobby Abrams|
52 Pepper Johnson|
55 Gary Reasons|
56 Lawrence Taylor|
57 Larry McGrew|
58 Carl Banks|
59 Brian Williams|
60 Eric Moore|
61 Bob Kratch|
64 Tom Rehder|
65 Bart Oates|
66 William Roberts|
70 Leonard Marshall|
72 Doug Riesenberg|
73 John Washington|
74 Erik Howard|
76 Jumbo Elliott|
77 Eric Dorsey|
80 Bob Mrosko|
81 Stacy Robinson|
82 Mark Ingram|
83 Odessa Turner|
84 Troy Kyles|
85 Stephen Baker|
86 Lionel Manuel|
87 Howard Cross|
89 Mark Bavaro|
93 Mike Fox|
98 Johnie Cooks|
99 Steve DeOssie|Head Coach:Bill Parcells|Coaches:Bill Belichick|Romeo Crennel|Tom Coughlin|Ron Erhardt|Al Groh|Ray Handley|Fred Hoaglin|Johnny Parker|Mike Pope|Mike Sweatman|Bob Trott|Charlie Weis