Lanaw ang Setu Pedongkelan sa Indonesya. Nahimutang ni sa lalawigan sa Daerah Khusus Ibukota Jakarta, sa kasadpang bahin sa nasod, 15 km sa habagatan sa Jakarta ang ulohan sa nasod. 59 metros ibabaw sa dagat kahaboga ang nahimutangan sa Setu Pedongkelan. Kinahabogang dapit sa palibot ang Gunung Gadung, 370 ka metros ni kahaboga ibabaw sa dagat, 19.5 km sa habagatan-sidlakan sa Setu Pedongkelan.