São Tomé és la capital i la ciutat principal de l'estat insular africà de São Tomé i Príncipe. Situada al nord-est de l'illa de São Tomé, l'any 2005 tenia 56.166 habitants. És també la capital del districte d'Água Grande. El seu important port és a la badia d'Ana Chaves, enmig de la qual s'alça l'illot de les Cabres. Està situada al nord-est de Trindade, al sud-est de Guadalupe i al nord-oest de Santana, ciutats amb les quals connecta a través de diverses carreteres i, sobretot, mitjançant l'autovia que ressegueix tota la costa de l'illa.