Modelització molecular de l'ADN
From Wikipedia, the free encyclopedia
Els models moleculars de les estructures de l'ADN són representacions de la topologia i la geometria molecular de l'àcid desoxiribonucleic (ADN) fent ús d'un dels diversos mètodes que existeixen per a fer-ho. Tenen com a principal objectiu simplificar i presentar les propietats essencials, tant físiques com químiques, de les estructures moleculars de l'àcid desoxiribonucleic en la seva forma in vivo i in vitro. Aquestes representacions consisteixen en esferes condensades fetes de plàstic (models de CPK), filferros metàl·lics per a l'esquelet, càlculs gràfics i animacions artístiques fetes mitjançant un ordinador. A més, aquests models informatitzats de l'ADN permeten fer representacions animades i simulacions dinàmiques de la seva estructura que són de gran importància per a la comprensió de com treballa in vivo la molècula d'ADN.
Els models moleculars de l'ADN més innovadors fets a partir de programes informàtics inclouen simulacions de les seves dinàmiques moleculars, així com càlculs de la mecànica quàntica dels moviments vibracionals i rotacionals, dels orbitals moleculars deslocalitzats (abreviatura anglesa: MOs), dels moments dipolars elèctrics i dels ponts d'hidrogen, entre d'altres. En aquestes representacions també s'hi poden trobar simulacions de la geometria molecular de l'ADN i canvis en la seva topologia produïts al llarg del temps causats per les interaccions tant intra com intermoleculars d'aquesta molècula. Mentre que els models moleculars de l'àcid desoxiribonucleic (ADN) com els consistents en esferes condensades (models CPK) fetes de plàstic i filferro pels braços de l'esquelet són útils per a les representacions estàtiques de l'estructura de la molècula, tenen poca funcionalitat per a les representacions complexes de les dinàmiques de l'ADN. Els models informatitzats de la molècula permeten animacions i simulacions dinàmiques que, com s'ha expressat anteriorment, tenen una gran importància per a l'estudi del funcionament de l'ADN in vivo.