From Wikipedia, the free encyclopedia
CIITA je ljudski gen sa p kraka hromosoma 16, koji kodira protein zvani transaktivator klase II glavog kompleksa histokompatibilnosti.[5] Mutacije ovog gena su odgovorne za sindrom golih limfocita u kojem je imunski sistem ozbiljno ugrožen i ne može se efikasno boriti protiv infekcije.[5] Hromosomskim preuređenjem CIITA-e uključeno je u patogenezu Hodgkinovog limfoma i primarnog medijastinskog B-ćelijskog limfoma.[6]
Dužina polipeptidnog lanca je 1.130 aminokiselina, a molekulska težina 123.514 Da.
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRCLAPRPAG | SYLSEPQGSS | QCATMELGPL | EGGYLELLNS | DADPLCLYHF | ||||
YDQMDLAGEE | EIELYSEPDT | DTINCDQFSR | LLCDMEGDEE | TREAYANIAE | ||||
LDQYVFQDSQ | LEGLSKDIFK | HIGPDEVIGE | SMEMPAEVGQ | KSQKRPFPEE | ||||
LPADLKHWKP | AEPPTVVTGS | LLVRPVSDCS | TLPCLPLPAL | FNQEPASGQM | ||||
RLEKTDQIPM | PFSSSSLSCL | NLPEGPIQFV | PTISTLPHGL | WQISEAGTGV | ||||
SSIFIYHGEV | PQASQVPPPS | GFTVHGLPTS | PDRPGSTSPF | APSATDLPSM | ||||
PEPALTSRAN | MTEHKTSPTQ | CPAAGEVSNK | LPKWPEPVEQ | FYRSLQDTYG | ||||
AEPAGPDGIL | VEVDLVQARL | ERSSSKSLER | ELATPDWAER | QLAQGGLAEV | ||||
LLAAKEHRRP | RETRVIAVLG | KAGQGKSYWA | GAVSRAWACG | RLPQYDFVFS | ||||
VPCHCLNRPG | DAYGLQDLLF | SLGPQPLVAA | DEVFSHILKR | PDRVLLILDG | ||||
FEELEAQDGF | LHSTCGPAPA | EPCSLRGLLA | GLFQKKLLRG | CTLLLTARPR | ||||
GRLVQSLSKA | DALFELSGFS | MEQAQAYVMR | YFESSGMTEH | QDRALTLLRD | ||||
RPLLLSHSHS | PTLCRAVCQL | SEALLELGED | AKLPSTLTGL | YVGLLGRAAL | ||||
DSPPGALAEL | AKLAWELGRR | HQSTLQEDQF | PSADVRTWAM | AKGLVQHPPR | ||||
AAESELAFPS | FLLQCFLGAL | WLALSGEIKD | KELPQYLALT | PRKKRPYDNW | ||||
LEGVPRFLAG | LIFQPPARCL | GALLGPSAAA | SVDRKQKVLA | RYLKRLQPGT | ||||
LRARQLLELL | HCAHEAEEAG | IWQHVVQELP | GRLSFLGTRL | TPPDAHVLGK | ||||
ALEAAGQDFS | LDLRSTGICP | SGLGSLVGLS | CVTRFRAALS | DTVALWESLQ | ||||
QHGETKLLQA | AEEKFTIEPF | KAKSLKDVED | LGKLVQTQRT | RSSSEDTAGE | ||||
LPAVRDLKKL | EFALGPVSGP | QAFPKLVRIL | TAFSSLQHLD | LDALSENKIG | ||||
DEGVSQLSAT | FPQLKSLETL | NLSQNNITDL | GAYKLAEALP | SLAASLLRLS | ||||
LYNNCICDVG | AESLARVLPD | MVSLRVMDVQ | YNKFTAAGAQ | QLAASLRRCP | ||||
HVETLAMWTP | TIPFSVQEHL | QQQDSRISLR |
CIITA iRNK može se detektovati samo u ljudskom leukocitnzm antigenima (HLA) sistema klase II-pozitivne ćelijske linije i tkiva. Ova vrlo ograničena distribucija tkiva sugerira da je ekspresija gena HLA klase II u velikoj mjeri pod kontrolom CIITA-e.[7] Međutim, izgleda da se CIITA ne vezuje direktno za DNK.[7] Umjesto toga CIITA funkcionira kroz aktivaciju transkripcijskog faktora RFX5.[8] Stoga je CIITA klasifikovan kao transkripcijski koaktivator.
CIITA protein sadrži kiseli domenski aktivator transkripcije, 4 LRRs (leucinom bogatih ponavljanja) i GTP vezujući domen.[9] Protein koristi GTP vezivanje kako bi olakšao vlastiti transport u jedro.[10] Jednom u jedru, protein djeluje kao pozitivan regulator transkripcija gena, glavnog kompleksa histokompatibilnosti klase II i često se naziva "master kontrolni faktor" za ekspresiju ovih gena.[11][12]
Ekspresiju CIITA inducira interferon gama, možda potpomognut drugim signalima.[13] MHC II ekspresija u ćelijama crijevnog epitela je pojačana pod upalom.[13]
Pokazalo se da CIITA interraguje sa:
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.