寡核苷酸
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寡核苷酸是短 DNA 或 RNA低聚物,在基因检测、研究和法医学方面有广泛的应用。寡核苷酸通常在实验室里通过固相化学合成法制备[1],并可以按照用户的需求合成指定序列的小片段核酸,对基因合成、聚合酶链式反应(PCR)、DNA测序、分子克隆至关重要。在自然界中,寡核苷酸通常以小RNA分子的形式出现 ,在基因表达的调控中发挥作用(如microRNA)[2];或者是较大核酸分子分解后的降解中间体。
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寡核苷酸的特点是由构成整个分子的核苷酸残基序列决定的。寡核苷酸的长度通常用"-mer"(来自希腊语meros,"部分"的意思)来表示。例如,具有6个核苷酸(nucleotide, nt)的寡核苷酸,被称为六聚体,而一个25 nt的寡核苷酸通常被称为 "25-mer"。寡核苷酸很容易以序列互补的方式与各自的互补寡核苷酸、DNA或RNA结合形成双链体,或较少的更高级别的混合体。这一基本特性是使用寡核苷酸作为探针来检测DNA或RNA特定序列的基础。使用寡核苷酸的应用包括DNA微阵列,Southern印迹,等位基因特异性寡核苷酸分析[3], 荧光原位杂交(FISH),PCR和人工基因的合成。
寡核苷酸由2'-脱氧核糖核苷酸组成,可以在骨架上或脱氧核糖的2号位进行修饰,以达到不同的药理效果。这些修饰使寡核苷酸具有新的特性,使其成为反义的关键因素[4][5]。